На основании приложения № 2 к Постановлению Кабинета Министров РУз от 18.12. 2009 г. №319 «Положение о клинической ординатуре» в целях расширения объема знаний и навыков клинические ординаторы могут привлекаться к выполнению научной работы (составление рефератов, тематический анализ и обзор литературы, освещение некоторых положений в медицинской практике, выступления с докладами на конференциях, клинические испытания новых лекарственных средств и др.), осуществляемой вне индивидуального плана подготовки клинического ординатора.

Деятельность отдела клинической ординатуры регламентируется Законами «Об образовании», «О национальной программе подготовки кадров» и другими нормативно-правовыми документами. Это часть многоуровневой структуры высшего медицинского образования, задачей которой является подготовка высококвалифицированных специалистов для самостоятельной работы в учреждениях здравоохранения.

Перечень медицинских специальностей и квалификаций, по которым проводится подготовка в клинической ординатуре в Ташкентском педиатрическом медицинском институте:
— Акушерство и гинекология
— Аллергология и клиническая иммунология
— Анестезиология и реаниматология
— Дерматовенерология
— Детская хирургия
— Детская анестезиология и реаниматология
— Детская неврология
— Детская и подростковая гинекология
— Детские инфекционные болезни
— Детская нефрология с гемодиализом
— Инфекционные болезни
— Кардиология
— Медицинская психология
— Медицинская радиология
— Неврология
— Нейрохирургия
— Неонатология
— Нефрология с гемодиализом
— Хирургия
— Онкология
— Оториноларингология
— Офтальмология
— Педиатрия
— Психиатрия
— Пластическая хирургия
— Терапия
— Травматология и ортопедия
— Фтизиатрия
— Челюстно-лицевая хирургия
— Эндокринология
— Эпидемиология