Единственный Ташкентский педиатрический медицинский институт в Центральной Азии был создан в 1972 году под эгидой Центральноазиатского педиатрического медицинского института в оригинальном Советском Союзе: «Создание Центральноазиатского медицинского педиатрического института в Ташкенте: в 1972 году в городе Ташкенте Союз педиатров для создания Центральноазиатского медицинского педиатрического института на базе педиатрических факультетов Ташкентского и Андижанского медицинских учреждений », — писал Ташкентский институт педиатрии, 5-я инфекционная больница в Ташкенте, современное общежитие ТашПМИ и взрослая клиника. Официальное открытие института состоялось 7 сентября 1972 года, его название называлось Центрально азиатским педиатрическим медицинским институтом — SAMPI. Основная цель института заключалась в подготовке высококвалифицированных врачей и педиатров для среднеазиатских республик и Южного Казахстана. Причиной этого было большое количество детей в республиках Центральной Азии, отсутствие педиатров в регионе, высокий уровень заболеваемости и смертности среди детей и отсутствие передовых педиатров. Ректором Института был заместитель министра здравоохранения Узбекистана, доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой инфекционных заболеваний ТашМИ В.Маджидов. Позже он был назначен на должность проректора по академическим наукам, доктор медицинских наук, проф. Долимов, проректор по научной работе, доктор медицинских наук, проф. М.А.Камалов, проректор по экономическим вопросам, профессор, старший преподаватель, старший преподаватель С.Шами и декан медицинского факультета, профессор, доктор медицинских наук, профессор Ф.Х.Назармухаммедов, были назначены. До открытия института началась очень тяжелая подготовительная работа. Были определены основные задачи, которые должны быть реализованы незадолго до начала учебного года: предоставление 40 факультетов профессорами, преподавателями, учебным оборудованием и учебными базами, создание новой библиотеки, организация экономической деятельности института, педиатрических факультетов Ташкентского и Андижанского медицинских институтов  , переезд студентов 2-6 курсов и предоставление им общежитий, прием студентов в первый год, а с 1 сентября  организация обучения на 1-6 курсах. Следует отметить, что новая команда нового института провела большую общественную работу во время летних каникул в течение двух месяцев, основные задачи были выполнены и обучение началось в сентябре 1972 года. Команда нового института начала обучение в 6 курсах одновременно и успешно прошла через тяжелые испытания. В рамках организации было создано 18 теоретических отделов, 6 лекционных кафедр и ректорат, 22 клинических отделения в Ташкенте и Ташкентской области. В то время ТашМИ и его подразделениям предоставлялась материальная помощь — учебное оборудование, мебельные книги и т. Д. В 1972-1973 учебном году к первому году было допущено 703 студента, в институт вошли 3170 студентов, представляющих 32 национальности. Зачислено 60 студентов из Таджикистана, Кыргызстана и Туркменистана, 60 из Узбекистана и других частей бывшего Советского Союза. В конце этого учебного года 449 студентов успешно окончили институт. Начиная с сентября 1972 года были избраны первые общественные организации, и они были активными. Секретарем партийной организации был доцент Н.Х. Эшметов, доцент Р.К.Курбонов, председатель Профсоюза профсоюзов, председатель студенческого профсоюза. Е.И. Турсунов, Л.Иванова была избрана членом комсомольской организацией. Позже, школа молодых педагогов (глава проф. К. С. Сулеймонова), координационный совет (председатель У.З.Кадыров), общество «Билим» (глава профессора В.А.Алимова) начали свою деятельность в преподавательской и другой деятельности. К следующему учебному году число достигло 800, а через несколько лет оно достигло 1000. Каждый год около 50 студентов из Туркменистана, Кыргызстана, Таджикистана и Южного Казахстана около 15 студентов зачислены на первый год обучения, и около 600 студентов были зачислены из регионов  Республики Узбекистан. Институт оставался в руках бывшего Министерства здравоохранения СССР до 1988 года, а затем передан в Министерство здравоохранения Узбекистана. С тех пор студенты были приняты в соседние страны. С 28 апреля 1989 года Центральноазиатский медицинский педиатрический институт был переименован в Ташкентский педиатрический медицинский институт — Ташкентский педиатрический медицинский институт по приказу Министерства здравоохранения Республики Узбекистан № 357. С 1990 по 1991 год в Нукусе открылся филиал института, а директором филиала был назначен профессор кафедры биохимии института Дж. М. Мамутов.

В настоящее время директором филиала является О.А.Антаниязова. За прошедший период ТашПМИ подготовил около 30 000 врачей — педиатров, детских хирургов и инфекционистов из которых 1065 выпускников окончили с отличием. В связи с увеличением количества студентов были расширены здания, учебные корпусы, клинические базы, общежития: в 1976-1978 годах было введено в эксплуатацию 5 общежитий с 1860 койками, в 1976 году на территории института появилось новое современное морфологическое здание, в 1981 году образовательное и лечебное здание — школа САМПИ, новая детская клиника в 1985 году и 4-этажное учебно-административное здание в 1990 году. С 1977 года был открыт специальный учебный курс для подготовки студентов к поступлению в институт. Позже этот курс был переведен на факультет подготовки Х.Хакимов был первым деканом, затем заведующим кафедрой был проф. С. Солоходжаев.  Если в 1974 — 1975 годы в ТашПМИ более 3,5 тысячам студентам преподавали: 19 профессоров, 54 доцента ,178 ассистентов (из них 103 кандидаты наук), то к 2000 — 2001 годам из 349 преподавателей, преподававшим 2514 студентам, 46 были докторами наук, 138 кандидатами наук. К 2012 году из 522 профессоров, преподающих  около 3.000 студентам, 63 доктора наук, а 218 кандидаты наук.

После того как Республика Узбекистан обрела независимость, были начаты крупные реформы в области медицинского образования, как и в других областях- была разработана новая национальная учебная программа и, согласно этой учебной программе, в медицинских институтах была создана 2 уровневая подготовка врачей общей практики и магистров (бакалавриат и магистратура). В настоящее время в медицинских институтах в частности, в ТашПМИ определено 7 лет обучения для становления врачом общей практики. Начиная с 2000-2001 учебного года ТашПМИ начал подготовку магистров по следующим специальностям:

M 720201 Педиатр — продолжительность обучения 3 года

M 720201 Анестезиолог-реаниматолог-3 года

M 720123 Семейный врач — 3 года

К 2012 году количество специальностей по магистратуре достигло 25.

В соответствии с проводимыми реформами в республике  в сфере образования в соответствии с требованиями рыночной экономики по созданию качественных кадров, особое внимание уделяется подготовке квалифицированных педиатров. За годы независимости число медицинских институтов увеличилось. До Независимости их число достигло трех в нашей стране, а теперь 9 с тремя филиалами. Учитывая это, с 1998 года количество студентов, поступивших в ТашПМИ, сократилось до 410, и поступление в институт было начато на основе тестов с 1994 года. Данная форма приема в институт открыла возможности для одаренных студентов. С 1995 года институт также начинает рассматривать осуществление приема студентов на основании договора, и в соответствии с Указом Президента Республики Узбекистан помимо бюджетной основы с 1997 года разрешается зачислять студентов на основании договора. С одной стороны, это подходило гражданам, удалось удовлетворить потребности некоторых общин, а с другой — сыграли большую роль в материальном развитии институтов государственного бюджета с точки зрения эффективности преподавания и материальных стимулов для учителей в рыночной экономике. Эффективность образовательного процесса находилась в центре внимания руководства института с момента его основания.