Профсоюз ТашПМИ в сотрудничестве с администрацией института обеспечивает социально-экономическую защиту профессорско-преподавательского состава и работников, гарантирует защиту их прав и интересов на основании Конституции Республики Узбекистан, Трудового кодекса Республики Узбекистан, приказов и указов Министерства юстиции, Министерства здравоохранения и Министерства труда. Рабочий процесс осуществляется на основании заключения и утверждения коллективного договора, действующего в течение года.
Профсоюз ТашПМИ был основан в 1972 году как общественная организация.
Состав Профсоюза ТашПМИ включает персонал института (845), детской клиники (886) и консультативной поликлиники (40) при институте, а также персонал Республиканского скрининг-центра (55), и в общей сложности 1786 человека являются членами профсоюза. Из них 566 мужчин и 1220 женщин. При профсоюзе работает 8 рабочих групп. Согласно штатному расписанию, Профсоюз ТашПМИ состоит из 1,5 штатных единиц, 0,5 из которых заняты председателем Профсоюза и 1,0 единица занята главным бухгалтером Профсоюза.
Профсоюз ТашПМИ был основан в 1972 году как общественная организация.