В 1972 году по приказу Министерства здравоохранения Узбекской ССР организован деканат Среднеазиатского медицинского педиатрического института. С 1977 года организованы I-й и II-й педиатрические факультеты.

В своей деятельности деканат руководствуется законами Республики Узбекистан, приказами Министерства высшего и среднего специального образования, а также нормативной-правовыми документами, принятыми в Ташкентском педиатрическом медицинском институте и считается структурной единицей института.