Отдел бухгалтерии работает со дня основания института, а именно с 1972 года

За этот период  отделом руководили:

  1. Фристова Зоя Фёдоровна 1972-1985
  2. Киселёв Владислав Михайлович 1985-1987
  3. Дятлова Лидия Николаевна 1987-1992
  4. Собирова Мархамат Касимовна 1992-1997
  5. Исакова Татьяна Александровна 1997-1999
  6. Қодиров Хақберди Восиевич 1999-2004
  7. Юлдашев Нодир Абидович 2004-2008
  8. Мардонов Холмирза Мамараимович  2008 — по настоящее время.