В 1947 году по инициативе заведующего кафедрой общей хирургии ТашГОСМИ, проф. Геллер Г. А. был открыт первый в Средней Азии курс «Детской хирургии». Возглавил курс доц. Тагиров К.Х. с молодыми выпускниками педиатрического факультета М.А. Романовой, А.И. Шариповой, С.Ф. Мушенковой, К.Г. Каюмовым. Это был первый курс, в последующем кафедра детской хирургии не только в Узбекистане, но и в Средней Азии, пятая по счету среди 15 республик Советского Союза.
Приказом Минздрава УзССР (№323 от 24 февраля 1959 года) при вновь открытой городской детской больнице №10 (по ул. Пушкинской) была организована детская хирургическая клиника на 150 коек, которая стала основной базой кафедры детской хирургии. В результате, клиника стала приобретать известность среди населения не только Узбекистана, но и других республик. Детей с хирургическими заболеваниями стали привозить в клинику детской хирургии из Таджикистана, Казахстана, Туркмении, Киргизии и отдельных регионов РСФСР.
В организации и развитии кафедры большую роль сыграл основоположник детской хирургической школы в России профессор С.Д. Терновский. Нельзя не отметить вклад в подготовку квалифицированных детских хирургов для нашей республики соратников и учеников С.Д.Терновского академиков Ю.Ф.Исакова, Э.А.Степанова, В.А.Михельсон, член.корреспондентов РАМН С.Я.Долецкого, Г.А.Баирова, профессоров А.Ф.Ленюшкина, А.Ф.Леонтьева.
В 1964 году кафедра получила новую базу при 14-й городской детской больнице (по ул. Луначарское шоссе) на 180 коек, где были открыты 3 хирургических отделения: плановая, экстренная хирургия с травматологией и урология. С расширением коечного фонда клиники улучшилась и учебно-педагогическая работа кафедры. Появилась возможность демонстрации больных по экстренной и плановой хирургии студентам на лекциях и практических занятиях. Оперативная деятельность кафедры значительно увеличилась. Если в 1947 году всего было проведено 34 операции, то в течение 1948-1955 гг. ежегодно проводилось от 400 до 1000 операций. С 1960 года после расширения клиники количество операций достигло 4000-5000 ежегодно.
Приказом Минздрава УзССР при кафедре детской хирургии был открыт методический центр для организации и руководства детской хирургической помощи в республике. По инициативе методического центра в областных центрах Узбекистана были открыты отделения детской хирургии: в Бухаре – 75, Андижане – 75, Самарканде – 45, Термезе – 45, Фергане – 25, Намангане – 25, Ургенче – 35, Карши – 160, Каракалпакской АССР – 60. В городах Андижане и Самарканде открыты кафедры детской хирургии, которые возглавили профессора Рахимов С.Р., Ахмедов М.А., Шамсиев А.М.
В 1972 году в связи с открытием Среднеазиатского Медицинского Педиатрического института (САМПИ) в городе Ташкенте кафедра детской хирургии ТашГосМИ была разделена на две кафедры. При ТашГосМИ была сохранена кафедра детской хирургии лечебного факультета, которую до 1992 года возглавлял профессор А. Э. Сайдалиев, а с 1993 по 2003 гг. – проф. Алиев М.М.
Основная часть кафедры целиком передана в ведение вновь созданного Среднеазиатского медицинского педиатрического института (САМПИ), которой продолжил заведовать проф. Тагиров К.Х. до 1979 г. На кафедре работали: профессор Э.М.Ходиев, доцент А.С. Сулайманов, Ш.Б. Тургунов, Т.А. Лигай, ассистенты: И.И. Исканджанов, Г.К. Исламбеков; С.Р. Расулев, Р.К.Каримов, Б.С.Турсунов, У.Л.Хожиберганов, М.М.Мирахмедов, Н.Э.Эргашев, Э.И.Илясов, Р.А. Алимджанов, Ж.Б.Бекназаров, Н.У.Утегенов, М.М.Алиев, Т.С.Агзамходжаев из них 6 имели ученую степень кандидата медицинских наук. Кафедра располагалась на трёх клинических базах: 14 детская больница – основная база по детской хирургии (60 коек); 17 городская больница, где находился курс травматологии с ортопедией детского возраста (80 коек); городской онкологический диспансер, где находился курс детской онкологии – 40 коек.
Наряду с педагогической и лечебной работой сотрудники кафедры проводили большую научно-исследовательскую работу по проблемам мочекаменной болезни, остеомиелитов, эхинококковой болезни, инородных тел желудочно-кишечного тракта, аппендицита, кишечной инвагинации, ожогов пищевода, пороков развития желудочно-кишечного тракта и хирургической инфекции.
С увеличением числа студентов поступающих из республик Средней Азии в САМПИ кафедра разделилась на две: кафедра детской хирургии № 1 (1-педиатрического факультета) и кафедра детской хирургии № 2 (2- педиатрического факультета).
Курс онкологии «Средно-Азиатского Медицинского Педиатрического Института», нынешний Ташкентский педиатрический медицинский институт был организован на базе кафедры «Детской хирургии» в 1972 году. Первым заведующим курсом онкологии был к.м.н. доцент Лигай Тимофей Андреевич (1924-1997), возглавлявший курс до 1996 года. В 1946 году он закончил лечебный факультет Ташкентский Государственный Медицинский Институт. В 1952 году закончил клиническую ординатуру по «Общей Хирургии». В 1996 году защитил кандидатскую диссертацию на тему: «Краевые особенности распространения рака кожи в Узбекистане». Базой курса был Республиканский центр детской онкологии, дислоцированный на территории Ташкентского Городского онкологического диспансера.
Мун Михаил Афанасьевич (1950- 2008). В 1978 году закончил педиатрический факультет Средно-Азиатского Медицинского Педиатрического Института. В 1980-82гг прошел клиническую ординатуру по «Детской хирургии». В 1986 году проходил первичную специализацию по детской онкологии в Всесоюзном Онкологическом Научном Центре Академии Медицинских Наук СССР и работал ассистентом курса «Онкологии». С 1996-1998 гг. заведовал курсом онкологии. С 1998- 2008 гг. курс онкологии был закрыт, а преподавание предмета онкологии было передано на кафедру «Госпитальной детской хирургии, урологии и онкологии» и Михаил Афанасьевич в качестве ассистента этой кафедры преподавал предмет онкологии.
24 декабря 2008 года приказом ректора Ташкентского Педиатрического Медицинского института профессора А. В. Алимова открыт курс «Онкологии с детской онкологией» и заведующим курса назначен д.м.н. Голиб Абдуллаевич Хакимов.
Основной клинической базой курса «онкологии с детской онкологией» является Городской онкологический диспансер г.Ташкента. Коечный фонд диспансера составляет 225 коек.