Инспекция внутреннего контроля была создана в 1997 году в целях контроля качества образовательного процесса в государственных образовательных учреждениях, повышения качества подготовки кадров, совершенствования образования. При этом Инспекция внутреннего контроля осуществляла контроль за исполнением указов, постановлений и распоряжений Президента Республики Узбекистан, решений и распоряжений Кабинета Министров, приказов и поручений вышестоящих организаций, проводила работу по обращениям граждан, по укреплению исполнительской дисциплины.

С момента создания название отдела несколько раз менялось: в 1997-2001 годах – отдел назывался «Отдел внутренней инспекции», в 2001-2020 годах — «Отдел внутреннего контроля и мониторинга», с 2020 года по настоящее время «Отдел по работе с обращениями физических и юридических лиц, контроля и мониторинга».

За 25-летний период отдел возглавляли следующие сотрудники:

1997-2001 годы
Начальник отдела внутренней инспекции доцент Махмудова Л.У.
2001-2002 годы
Начальник отдела внутренней инспекции, доцент Джубатова Р.С.
2002-2010 года
Начальник отдела внутреннего контроля и мониторинга, доцент Даминова М.Н
2010-2019 годы
Начальник отдела внутреннего контроля и мониторинга, доцент Махкамова Г.Г.
2019-2020 годы
 Начальник отдела внутреннего контроля и мониторинга,  профессор Т.С. Агзамходжаев

С 2020 года по настоящее время начальник отдела по работе с обращениями физических и юридических лиц, контроля и мониторинга профессор Рузиев Ш.И.