Отдел подготовки научных кадров был организован в 1972 году. В 2005 году по поручению Кабинета Министров РУз № 07G’8-68 и согласно модеммограме № 8G’7-04-127 от 25 августа 2005 года отдел был переименован в отдел подготовки научных и научно-педагогических кадров.

С 1974 по 2006 год отделом возглавляла Тамара Азизовна Костюченко.

2006 — 2008 гг. руководила отделом Закирова Наргиза Бахадировна.

С 2008 года до сегодняшнего дня отдел научных исследований, инноваций и подготовки научно-педагогических кадров возглавляет Абзалова Шахноза Рустамовна.

С 2005 года по 2022 год отдел называется Отдел научных исследований, инноваций и подготовки научно-педагогических кадров. С сентября месяца 2022 года отдел переименован в Отдел научных исследований, инноваций.